Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G1

PCDHGB3, Protocadherin gamma-B3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB3Q9Y5G1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGB3Q9Y5G1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms