Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC42Q9Y546 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms