Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIF3AQ9Y496 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF3AQ9Y496 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms