Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMED5Q9Y3A6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED5Q9Y3A6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms