Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFT52Q9Y366 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT52Q9Y366 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms