Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M1Q9Y2T2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms