Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP20Q9Y2K6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms