Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L3Q9Y2J2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms