Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSX2IPQ9Y2D8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms