Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNRC6BQ9UPQ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms