Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF19Q9UMS4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms