Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP17Q9ULZ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP17Q9ULZ9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms