Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD4Q9ULV1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD4Q9ULV1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD4Q9ULV1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD4Q9ULV1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD4Q9ULV1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD4Q9ULV1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms