Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA11Q9UKX5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms