Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4Q9UKN8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms