Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXL4Q9UKA2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXL4Q9UKA2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms