Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNMT3LQ9UJW3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT3LQ9UJW3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3LQ9UJW3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3LQ9UJW3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3LQ9UJW3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3LQ9UJW3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3LQ9UJW3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3LQ9UJW3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3LQ9UJW3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT3LQ9UJW3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT3LQ9UJW3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms