Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX2Q9UIW0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms