Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC24A2Q9UI40 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC24A2Q9UI40 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC24A2Q9UI40 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms