Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PUF60Q9UHX1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms