Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPN3Q9UHW5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms