Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms