Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF1Q9UH73 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms