Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGN4

CD300A, CMRF35-like molecule 8, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300AQ9UGN4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD300AQ9UGN4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD300AQ9UGN4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms