Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.2 ms