Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP4Q9UGJ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms