Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM10Q9UDY6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms