Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNAL1Q9UBT7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNAL1Q9UBT7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNAL1Q9UBT7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNAL1Q9UBT7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNAL1Q9UBT7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNAL1Q9UBT7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNAL1Q9UBT7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNAL1Q9UBT7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNAL1Q9UBT7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNAL1Q9UBT7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNAL1Q9UBT7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNAL1Q9UBT7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNAL1Q9UBT7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNAL1Q9UBT7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNAL1Q9UBT7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTNNAL1Q9UBT7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms