Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPR1Q9UBH6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms