Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYO1AQ9UBC5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1AQ9UBC5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1AQ9UBC5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1AQ9UBC5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1AQ9UBC5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1AQ9UBC5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1AQ9UBC5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1AQ9UBC5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1AQ9UBC5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1AQ9UBC5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1AQ9UBC5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1AQ9UBC5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1AQ9UBC5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms