Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC49.05■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC49.04■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.04■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC49.04■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC49.02■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.01■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC49.01■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC49.01■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC49.01■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC49.01■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC48.98■■■■■ 5.43
CCDC180Q9P1Z9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC48.98■■■■■ 5.43
CCDC180Q9P1Z9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC48.98■■■■■ 5.43
CCDC180Q9P1Z9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.98■■■■■ 5.43
CCDC180Q9P1Z9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.98■■■■■ 5.43
CCDC180Q9P1Z9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.97■■■■■ 5.43
CCDC180Q9P1Z9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.97■■■■■ 5.43
CCDC180Q9P1Z9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
CCDC180Q9P1Z9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
CCDC180Q9P1Z9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
CCDC180Q9P1Z9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC48.94■■■■■ 5.43
CCDC180Q9P1Z9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC48.94■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC48.94■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.94■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.93■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.93■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC48.93■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC48.92■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC48.91■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC48.91■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC48.9■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.89■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC48.89■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.89■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC48.88■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC48.88■■■■■ 5.42
CCDC180Q9P1Z9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
CCDC180Q9P1Z9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC48.87■■■■■ 5.41
CCDC180Q9P1Z9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
CCDC180Q9P1Z9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC48.87■■■■■ 5.41
CCDC180Q9P1Z9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC48.86■■■■■ 5.41
CCDC180Q9P1Z9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
CCDC180Q9P1Z9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
CCDC180Q9P1Z9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC48.86■■■■■ 5.41
CCDC180Q9P1Z9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
CCDC180Q9P1Z9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC48.85■■■■■ 5.41
CCDC180Q9P1Z9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
CCDC180Q9P1Z9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC48.84■■■■■ 5.41
CCDC180Q9P1Z9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.83■■■■■ 5.41
CCDC180Q9P1Z9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC48.83■■■■■ 5.41
CCDC180Q9P1Z9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
CCDC180Q9P1Z9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC48.81■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC48.81■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC48.81■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.8■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC48.8■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.8■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC48.8■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC48.8■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.79■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC48.78■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.77■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC48.76■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC48.76■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
CCDC180Q9P1Z9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC48.74■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC48.74■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC48.73■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC48.73■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC48.72■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms