Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDE1Q9NXR1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms