Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDAP2Q9NXN4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDAP2Q9NXN4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms