Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF38Q9NXL2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms