Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKS1Q9NXB0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms