Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED29Q9NX70 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms