Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM248Q9NWD8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM248Q9NWD8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms