Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM39AQ9NV64 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM39AQ9NV64 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms