Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TCP11L1Q9NUJ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCP11L1Q9NUJ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms