Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FOXD4L1Q9NU39 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms