Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EMILIN3Q9NT22 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms