Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PLSCR3Q9NRY6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms