Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS45Q9NRW7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms