Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDHAF3Q9NRP4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms