Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TULP4Q9NRJ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.85
TULP4Q9NRJ4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms