Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRAC1Q9NRG0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRAC1Q9NRG0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms