Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTPS2Q9NRF8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1165.7 ms