Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DUOX1Q9NRD9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX1Q9NRD9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms