Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C8orf4Q9NR00 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms