Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BIN3Q9NQY0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms